Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pitx2P97474 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pitx2P97474 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.7 ms