Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bop1P97452 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bop1P97452 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bop1P97452 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bop1P97452 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bop1P97452 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bop1P97452 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bop1P97452 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bop1P97452 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bop1P97452 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bop1P97452 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bop1P97452 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bop1P97452 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bop1P97452 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Bop1P97452 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bop1P97452 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bop1P97452 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bop1P97452 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bop1P97452 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms