Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Eif3eP60229 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Eif3eP60229 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Eif3eP60229 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms