Protein–RNA interactions for Protein: P54775

Psmc4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc4P54775 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Psmc4P54775 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmc4P54775 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmc4P54775 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.5 ms