Protein–RNA interactions for Protein: P48318

Gad1, Glutamate decarboxylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gad1P48318 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gad1P48318 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gad1P48318 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gad1P48318 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gad1P48318 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gad1P48318 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gad1P48318 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gad1P48318 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gad1P48318 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gad1P48318 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gad1P48318 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gad1P48318 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gad1P48318 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gad1P48318 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gad1P48318 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gad1P48318 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gad1P48318 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gad1P48318 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gad1P48318 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gad1P48318 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gad1P48318 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gad1P48318 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gad1P48318 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gad1P48318 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gad1P48318 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gad1P48318 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gad1P48318 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gad1P48318 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gad1P48318 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gad1P48318 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gad1P48318 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gad1P48318 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gad1P48318 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gad1P48318 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gad1P48318 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gad1P48318 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gad1P48318 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gad1P48318 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gad1P48318 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gad1P48318 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gad1P48318 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gad1P48318 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gad1P48318 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gad1P48318 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gad1P48318 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gad1P48318 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gad1P48318 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gad1P48318 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gad1P48318 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms