Protein–RNA interactions for Protein: P47753

Capza1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza1P47753 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capza1P47753 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capza1P47753 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capza1P47753 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capza1P47753 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capza1P47753 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capza1P47753 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capza1P47753 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capza1P47753 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capza1P47753 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capza1P47753 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capza1P47753 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capza1P47753 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capza1P47753 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capza1P47753 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capza1P47753 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capza1P47753 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capza1P47753 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capza1P47753 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capza1P47753 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capza1P47753 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capza1P47753 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capza1P47753 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capza1P47753 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capza1P47753 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Capza1P47753 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Capza1P47753 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms