Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nedd4P46935 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nedd4P46935 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nedd4P46935 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms