Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tacr1P30548 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tacr1P30548 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms