Protein–RNA interactions for Protein: P01793

Ig heavy chain V region HPCG13, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01793 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01793 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01793 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01793 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01793 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01793 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01793 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01793 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01793 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01793 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01793 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01793 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01793 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01793 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01793 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01793 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01793 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01793 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01793 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01793 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01793 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01793 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01793 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01793 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01793 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01793 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01793 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01793 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01793 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01793 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01793 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01793 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P01793 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01793 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01793 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01793 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01793 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01793 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01793 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01793 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01793 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01793 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01793 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01793 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01793 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01793 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01793 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01793 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01793 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01793 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01793 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01793 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01793 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01793 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01793 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01793 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01793 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01793 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01793 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01793 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01793 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01793 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01793 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01793 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01793 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01793 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01793 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01793 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01793 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01793 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01793 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01793 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01793 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01793 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01793 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01793 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01793 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01793 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01793 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01793 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01793 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01793 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01793 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01793 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01793 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01793 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01793 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01793 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01793 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01793 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01793 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01793 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01793 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01793 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01793 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01793 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01793 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01793 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01793 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01793 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms