Protein–RNA interactions for Protein: P01787

Ig heavy chain V regions TEPC 15/S107/HPCM1/HPCM2/HPCM3, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01787 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01787 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01787 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01787 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01787 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01787 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01787 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01787 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01787 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01787 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01787 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01787 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01787 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01787 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01787 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01787 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01787 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01787 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01787 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01787 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01787 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01787 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01787 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01787 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01787 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01787 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01787 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01787 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01787 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01787 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01787 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01787 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01787 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01787 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01787 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01787 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01787 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01787 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01787 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01787 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01787 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01787 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01787 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01787 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01787 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01787 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01787 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01787 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01787 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01787 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01787 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01787 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01787 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01787 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01787 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01787 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01787 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01787 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01787 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01787 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01787 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01787 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01787 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01787 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01787 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01787 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01787 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01787 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01787 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01787 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01787 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01787 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01787 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01787 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01787 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01787 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01787 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01787 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01787 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01787 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01787 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01787 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01787 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01787 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01787 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01787 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01787 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01787 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01787 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01787 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01787 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01787 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01787 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01787 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01787 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01787 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01787 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01787 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01787 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01787 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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