Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01669 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01669 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
P01669 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01669 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01669 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01669 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01669 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01669 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01669 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01669 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01669 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01669 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01669 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01669 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01669 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01669 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01669 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01669 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01669 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01669 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01669 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01669 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01669 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01669 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01669 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01669 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01669 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01669 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01669 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01669 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01669 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01669 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01669 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01669 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01669 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01669 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
P01669 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01669 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01669 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01669 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01669 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01669 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01669 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01669 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01669 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01669 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01669 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
P01669 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01669 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01669 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01669 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01669 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
P01669 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
P01669 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01669 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01669 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01669 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01669 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01669 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01669 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01669 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01669 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
P01669 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01669 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01669 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01669 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01669 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01669 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01669 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01669 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01669 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01669 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01669 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01669 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01669 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01669 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01669 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01669 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01669 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01669 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01669 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01669 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01669 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01669 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
P01669 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01669 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
P01669 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01669 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01669 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01669 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01669 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01669 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01669 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01669 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01669 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01669 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
P01669 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01669 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01669 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms