Protein–RNA interactions for Protein: O88851

Rbbp9, Putative hydrolase RBBP9, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp9O88851 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp9O88851 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp9O88851 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp9O88851 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp9O88851 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp9O88851 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rbbp9O88851 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp9O88851 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp9O88851 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp9O88851 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp9O88851 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp9O88851 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp9O88851 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp9O88851 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp9O88851 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp9O88851 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp9O88851 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbbp9O88851 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp9O88851 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp9O88851 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp9O88851 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp9O88851 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp9O88851 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbbp9O88851 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rbbp9O88851 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp9O88851 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp9O88851 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp9O88851 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp9O88851 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp9O88851 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp9O88851 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp9O88851 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp9O88851 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp9O88851 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp9O88851 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp9O88851 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rbbp9O88851 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp9O88851 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rbbp9O88851 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms