Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpd52l1O54818 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpd52l1O54818 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpd52l1O54818 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpd52l1O54818 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpd52l1O54818 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpd52l1O54818 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpd52l1O54818 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpd52l1O54818 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpd52l1O54818 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpd52l1O54818 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpd52l1O54818 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpd52l1O54818 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpd52l1O54818 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpd52l1O54818 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpd52l1O54818 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpd52l1O54818 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpd52l1O54818 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpd52l1O54818 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpd52l1O54818 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpd52l1O54818 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpd52l1O54818 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpd52l1O54818 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpd52l1O54818 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpd52l1O54818 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpd52l1O54818 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpd52l1O54818 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpd52l1O54818 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tpd52l1O54818 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tpd52l1O54818 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tpd52l1O54818 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tpd52l1O54818 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpd52l1O54818 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 232.3 ms