Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChkaO54804 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChkaO54804 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChkaO54804 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChkaO54804 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChkaO54804 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChkaO54804 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChkaO54804 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ChkaO54804 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChkaO54804 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChkaO54804 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ChkaO54804 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChkaO54804 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChkaO54804 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChkaO54804 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChkaO54804 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChkaO54804 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChkaO54804 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChkaO54804 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChkaO54804 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChkaO54804 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChkaO54804 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChkaO54804 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ChkaO54804 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ChkaO54804 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ChkaO54804 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ChkaO54804 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ChkaO54804 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ChkaO54804 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ChkaO54804 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ChkaO54804 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ChkaO54804 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ChkaO54804 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ChkaO54804 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ChkaO54804 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ChkaO54804 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ChkaO54804 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ChkaO54804 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ChkaO54804 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ChkaO54804 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ChkaO54804 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ChkaO54804 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ChkaO54804 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ChkaO54804 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ChkaO54804 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ChkaO54804 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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