Protein–RNA interactions for Protein: O35393

Efnb3, Ephrin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb3O35393 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Efnb3O35393 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Efnb3O35393 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms