Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Kcns1O35173 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcns1O35173 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcns1O35173 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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