Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efna3O08545 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efna3O08545 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Efna3O08545 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efna3O08545 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efna3O08545 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efna3O08545 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efna3O08545 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Efna3O08545 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efna3O08545 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efna3O08545 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efna3O08545 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Efna3O08545 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efna3O08545 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efna3O08545 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efna3O08545 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efna3O08545 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Efna3O08545 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms