Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IfnabL7MTU6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IfnabL7MTU6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178.7 ms