Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bbip1J3QMK2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bbip1J3QMK2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bbip1J3QMK2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bbip1J3QMK2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bbip1J3QMK2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bbip1J3QMK2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bbip1J3QMK2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bbip1J3QMK2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bbip1J3QMK2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bbip1J3QMK2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bbip1J3QMK2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bbip1J3QMK2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bbip1J3QMK2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bbip1J3QMK2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bbip1J3QMK2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Bbip1J3QMK2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bbip1J3QMK2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bbip1J3QMK2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bbip1J3QMK2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.9 ms