Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20825J3QM67 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20825J3QM67 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm20825J3QM67 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms