Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
2610001J05RikF2Z3Y9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
2610001J05RikF2Z3Y9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.4 ms