Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0P0

Gm8127, Predicted gene 8127, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8127E9Q0P0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8127E9Q0P0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8127E9Q0P0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8127E9Q0P0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8127E9Q0P0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8127E9Q0P0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8127E9Q0P0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8127E9Q0P0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8127E9Q0P0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8127E9Q0P0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8127E9Q0P0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8127E9Q0P0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8127E9Q0P0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8127E9Q0P0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8127E9Q0P0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8127E9Q0P0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8127E9Q0P0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8127E9Q0P0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8127E9Q0P0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8127E9Q0P0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8127E9Q0P0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8127E9Q0P0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8127E9Q0P0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8127E9Q0P0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8127E9Q0P0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8127E9Q0P0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8127E9Q0P0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8127E9Q0P0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8127E9Q0P0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8127E9Q0P0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8127E9Q0P0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8127E9Q0P0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8127E9Q0P0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8127E9Q0P0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8127E9Q0P0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8127E9Q0P0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8127E9Q0P0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms