Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp6ap1lD3Z5W0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp6ap1lD3Z5W0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms