Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3C6

Zfand4, AN1-type zinc finger protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfand4D3Z3C6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfand4D3Z3C6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfand4D3Z3C6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfand4D3Z3C6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfand4D3Z3C6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfand4D3Z3C6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfand4D3Z3C6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfand4D3Z3C6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfand4D3Z3C6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Zfand4D3Z3C6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfand4D3Z3C6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfand4D3Z3C6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfand4D3Z3C6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfand4D3Z3C6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfand4D3Z3C6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfand4D3Z3C6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfand4D3Z3C6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfand4D3Z3C6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfand4D3Z3C6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfand4D3Z3C6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfand4D3Z3C6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfand4D3Z3C6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfand4D3Z3C6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zfand4D3Z3C6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfand4D3Z3C6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfand4D3Z3C6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfand4D3Z3C6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfand4D3Z3C6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfand4D3Z3C6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfand4D3Z3C6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfand4D3Z3C6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zfand4D3Z3C6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfand4D3Z3C6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfand4D3Z3C6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfand4D3Z3C6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfand4D3Z3C6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfand4D3Z3C6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfand4D3Z3C6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zfand4D3Z3C6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms