Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tmf1B9EKI3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tmf1B9EKI3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tmf1B9EKI3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Tmf1B9EKI3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tmf1B9EKI3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tmf1B9EKI3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tmf1B9EKI3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tmf1B9EKI3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Tmf1B9EKI3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tmf1B9EKI3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tmf1B9EKI3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tmf1B9EKI3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tmf1B9EKI3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tmf1B9EKI3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tmf1B9EKI3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tmf1B9EKI3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmf1B9EKI3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmf1B9EKI3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmf1B9EKI3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmf1B9EKI3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmf1B9EKI3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tmf1B9EKI3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tmf1B9EKI3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tmf1B9EKI3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tmf1B9EKI3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Tmf1B9EKI3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tmf1B9EKI3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tmf1B9EKI3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Tmf1B9EKI3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tmf1B9EKI3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tmf1B9EKI3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tmf1B9EKI3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tmf1B9EKI3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tmf1B9EKI3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Tmf1B9EKI3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tmf1B9EKI3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tmf1B9EKI3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tmf1B9EKI3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tmf1B9EKI3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tmf1B9EKI3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tmf1B9EKI3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmf1B9EKI3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmf1B9EKI3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmf1B9EKI3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmf1B9EKI3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmf1B9EKI3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmf1B9EKI3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmf1B9EKI3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tmf1B9EKI3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tmf1B9EKI3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tmf1B9EKI3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tmf1B9EKI3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tmf1B9EKI3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tmf1B9EKI3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tmf1B9EKI3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tmf1B9EKI3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tmf1B9EKI3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tmf1B9EKI3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tmf1B9EKI3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tmf1B9EKI3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tmf1B9EKI3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tmf1B9EKI3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tmf1B9EKI3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Tmf1B9EKI3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tmf1B9EKI3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tmf1B9EKI3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms