Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hbb-bh2B2RVB7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hbb-bh2B2RVB7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hbb-bh2B2RVB7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hbb-bh2B2RVB7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hbb-bh2B2RVB7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hbb-bh2B2RVB7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hbb-bh2B2RVB7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hbb-bh2B2RVB7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hbb-bh2B2RVB7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hbb-bh2B2RVB7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hbb-bh2B2RVB7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hbb-bh2B2RVB7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hbb-bh2B2RVB7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hbb-bh2B2RVB7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hbb-bh2B2RVB7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hbb-bh2B2RVB7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hbb-bh2B2RVB7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hbb-bh2B2RVB7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hbb-bh2B2RVB7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hbb-bh2B2RVB7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hbb-bh2B2RVB7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hbb-bh2B2RVB7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hbb-bh2B2RVB7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hbb-bh2B2RVB7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hbb-bh2B2RVB7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hbb-bh2B2RVB7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hbb-bh2B2RVB7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hbb-bh2B2RVB7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms