Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apba1B2RUJ5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Apba1B2RUJ5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apba1B2RUJ5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms