Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkd2l1A2A259 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkd2l1A2A259 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkd2l1A2A259 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pkd2l1A2A259 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkd2l1A2A259 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkd2l1A2A259 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkd2l1A2A259 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkd2l1A2A259 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkd2l1A2A259 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkd2l1A2A259 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkd2l1A2A259 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkd2l1A2A259 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkd2l1A2A259 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkd2l1A2A259 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkd2l1A2A259 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkd2l1A2A259 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pkd2l1A2A259 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Pkd2l1A2A259 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pkd2l1A2A259 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkd2l1A2A259 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkd2l1A2A259 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkd2l1A2A259 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkd2l1A2A259 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkd2l1A2A259 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkd2l1A2A259 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkd2l1A2A259 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkd2l1A2A259 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkd2l1A2A259 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkd2l1A2A259 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pkd2l1A2A259 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkd2l1A2A259 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkd2l1A2A259 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkd2l1A2A259 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkd2l1A2A259 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkd2l1A2A259 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkd2l1A2A259 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkd2l1A2A259 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkd2l1A2A259 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pkd2l1A2A259 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pkd2l1A2A259 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms