Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdh13Q9WTR5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdh13Q9WTR5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdh13Q9WTR5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdh13Q9WTR5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdh13Q9WTR5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdh13Q9WTR5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdh13Q9WTR5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms