Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N8

Syt6, Synaptotagmin-6, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt6Q9R0N8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syt6Q9R0N8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Syt6Q9R0N8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms