Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Edf1Q9JMG1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Edf1Q9JMG1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms