Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmgn5Q9JL35 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hmgn5Q9JL35 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmgn5Q9JL35 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms