Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Slc12a4Q9JIS8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Slc12a4Q9JIS8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms