Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Cldn19Q9ET38 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cldn19Q9ET38 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cldn19Q9ET38 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cldn19Q9ET38 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cldn19Q9ET38 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cldn19Q9ET38 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cldn19Q9ET38 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn19Q9ET38 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn19Q9ET38 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn19Q9ET38 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn19Q9ET38 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn19Q9ET38 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn19Q9ET38 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn19Q9ET38 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cldn19Q9ET38 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms