Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
OtofQ9ESF1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
OtofQ9ESF1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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