Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER58

Spock2, Testican-2, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock2Q9ER58 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spock2Q9ER58 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spock2Q9ER58 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spock2Q9ER58 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Spock2Q9ER58 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spock2Q9ER58 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spock2Q9ER58 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spock2Q9ER58 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spock2Q9ER58 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spock2Q9ER58 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spock2Q9ER58 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Spock2Q9ER58 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spock2Q9ER58 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spock2Q9ER58 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spock2Q9ER58 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spock2Q9ER58 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spock2Q9ER58 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spock2Q9ER58 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spock2Q9ER58 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spock2Q9ER58 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spock2Q9ER58 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spock2Q9ER58 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spock2Q9ER58 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spock2Q9ER58 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spock2Q9ER58 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spock2Q9ER58 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spock2Q9ER58 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spock2Q9ER58 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spock2Q9ER58 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Spock2Q9ER58 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spock2Q9ER58 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spock2Q9ER58 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spock2Q9ER58 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spock2Q9ER58 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spock2Q9ER58 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spock2Q9ER58 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Spock2Q9ER58 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spock2Q9ER58 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spock2Q9ER58 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spock2Q9ER58 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spock2Q9ER58 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spock2Q9ER58 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spock2Q9ER58 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Spock2Q9ER58 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Spock2Q9ER58 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Spock2Q9ER58 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spock2Q9ER58 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms