Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cbx6Q9DBY5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cbx6Q9DBY5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx6Q9DBY5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms