Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ifrd2Q9D8U0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ifrd2Q9D8U0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifrd2Q9D8U0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms