Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slx4ipQ9D7Y9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slx4ipQ9D7Y9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slx4ipQ9D7Y9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slx4ipQ9D7Y9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slx4ipQ9D7Y9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slx4ipQ9D7Y9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slx4ipQ9D7Y9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slx4ipQ9D7Y9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slx4ipQ9D7Y9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slx4ipQ9D7Y9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms