Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3a3Q9D554 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3a3Q9D554 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3a3Q9D554 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3a3Q9D554 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3a3Q9D554 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3a3Q9D554 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3a3Q9D554 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3a3Q9D554 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3a3Q9D554 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3a3Q9D554 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3a3Q9D554 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3a3Q9D554 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3a3Q9D554 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3a3Q9D554 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3a3Q9D554 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3a3Q9D554 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3a3Q9D554 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3a3Q9D554 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3a3Q9D554 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sf3a3Q9D554 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sf3a3Q9D554 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sf3a3Q9D554 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3a3Q9D554 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3a3Q9D554 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3a3Q9D554 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3a3Q9D554 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3a3Q9D554 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3a3Q9D554 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3a3Q9D554 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3a3Q9D554 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3a3Q9D554 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3a3Q9D554 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sf3a3Q9D554 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms