Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam227bQ9D518 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fam227bQ9D518 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam227bQ9D518 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms