Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Katnal2Q9D3R6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Katnal2Q9D3R6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms