Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nol3Q9D1X0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nol3Q9D1X0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 337 ms