Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lsm12Q9D0R8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lsm12Q9D0R8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsm12Q9D0R8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms