Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NepnQ9CQ76 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NepnQ9CQ76 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NepnQ9CQ76 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NepnQ9CQ76 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NepnQ9CQ76 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NepnQ9CQ76 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NepnQ9CQ76 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NepnQ9CQ76 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NepnQ9CQ76 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NepnQ9CQ76 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NepnQ9CQ76 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NepnQ9CQ76 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NepnQ9CQ76 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NepnQ9CQ76 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NepnQ9CQ76 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NepnQ9CQ76 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NepnQ9CQ76 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NepnQ9CQ76 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NepnQ9CQ76 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NepnQ9CQ76 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NepnQ9CQ76 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NepnQ9CQ76 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NepnQ9CQ76 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NepnQ9CQ76 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NepnQ9CQ76 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NepnQ9CQ76 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NepnQ9CQ76 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NepnQ9CQ76 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NepnQ9CQ76 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NepnQ9CQ76 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NepnQ9CQ76 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NepnQ9CQ76 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms