Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Pcgf6Q99NA9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pcgf6Q99NA9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pcgf6Q99NA9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms