Protein–RNA interactions for Protein: Q99LB7

Sardh, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SardhQ99LB7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SardhQ99LB7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SardhQ99LB7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SardhQ99LB7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SardhQ99LB7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SardhQ99LB7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SardhQ99LB7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SardhQ99LB7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SardhQ99LB7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SardhQ99LB7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SardhQ99LB7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SardhQ99LB7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SardhQ99LB7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SardhQ99LB7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SardhQ99LB7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SardhQ99LB7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SardhQ99LB7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SardhQ99LB7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SardhQ99LB7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SardhQ99LB7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SardhQ99LB7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SardhQ99LB7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SardhQ99LB7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SardhQ99LB7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SardhQ99LB7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SardhQ99LB7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SardhQ99LB7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SardhQ99LB7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SardhQ99LB7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SardhQ99LB7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SardhQ99LB7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SardhQ99LB7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SardhQ99LB7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms