Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Spdl1Q923A2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spdl1Q923A2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spdl1Q923A2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms