Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Synpo2Q91YE8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Synpo2Q91YE8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms