Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC33

Nxnl1, Nucleoredoxin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxnl1Q8VC33 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxnl1Q8VC33 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxnl1Q8VC33 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxnl1Q8VC33 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxnl1Q8VC33 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxnl1Q8VC33 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxnl1Q8VC33 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxnl1Q8VC33 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxnl1Q8VC33 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxnl1Q8VC33 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxnl1Q8VC33 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxnl1Q8VC33 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nxnl1Q8VC33 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nxnl1Q8VC33 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nxnl1Q8VC33 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nxnl1Q8VC33 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nxnl1Q8VC33 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nxnl1Q8VC33 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nxnl1Q8VC33 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nxnl1Q8VC33 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Nxnl1Q8VC33 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nxnl1Q8VC33 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nxnl1Q8VC33 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nxnl1Q8VC33 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nxnl1Q8VC33 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nxnl1Q8VC33 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nxnl1Q8VC33 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nxnl1Q8VC33 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nxnl1Q8VC33 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nxnl1Q8VC33 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nxnl1Q8VC33 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nxnl1Q8VC33 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nxnl1Q8VC33 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nxnl1Q8VC33 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nxnl1Q8VC33 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nxnl1Q8VC33 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nxnl1Q8VC33 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nxnl1Q8VC33 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nxnl1Q8VC33 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nxnl1Q8VC33 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nxnl1Q8VC33 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nxnl1Q8VC33 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nxnl1Q8VC33 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nxnl1Q8VC33 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nxnl1Q8VC33 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nxnl1Q8VC33 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nxnl1Q8VC33 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nxnl1Q8VC33 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nxnl1Q8VC33 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nxnl1Q8VC33 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nxnl1Q8VC33 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms